包含mirdatabank的词条

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摘要:本文将从以下4个方面对包含mirdatabank的词条进行详细介绍,其中包括:mirdatabank的定义,数据库结构和内容,数据下载和应用以及未来展望。通过本文的介绍,读者将能够更好的了解mirdatabank及其在生命科学研究中的应用。

1、mirdatabank的定义

mirdatabank是microRNA(miRNA)的功能数据集合,是世界上最大的miRNA功能数据库之一。数据库中包含了关于miRNA靶基因和miRNA靶标间相互作用的详细信息,以及与miRNA在多种生物学过程中的调节相关联的信息。该数据库由日本东北大学理学部的Masao Saito教授和他的同事于2006年创建,目前包含了来自不同物种的miRNA和miRNA靶基因,包括人类、小鼠、小麦、拟南芥等。

目前,mirdatabank中的信息已经被广泛应用于基因表达调控、疾病诊断和治疗以及药物开发等领域。

2、数据库结构和内容

mirdatabank主要包含三个模块。第一个模块是miRNA靶基因的预测模块,该模块主要基于可靠的算法和实验证明,对miRNA靶基因进行预测,并提供靶基因的相关信息。第二个模块是miRNA的注释模块,该模块主要提供了miRNA的基本信息,包括miRNA名称、序列、调节网络和靶标基因等。第三个模块是miRNA的药物作用预测模块,该模块主要预测miRNA对特定化合物的响应,为miRNA在药物开发中的应用提供了支持。

3、数据下载和应用

用户可以通过mirdatabank的官方网站进行数据下载和使用。mirdatabank网站提供了多种下载选项,包括miRNA、靶基因、miRNA与靶基因相互作用等。此外,mirdatabank还提供了多种功能,如miRNA靶基因的预测、miRNA的注释以及miRNA的药物作用预测等。

目前,mirdatabank已经被广泛应用于生命科学研究中,尤其是在miRNA调控和药物开发方面的研究中。例如,一项研究利用mirdatabank预测了与脑血管缺损相关的miRNA靶基因,并发现miRNA-15a/16-1的靶基因在小鼠中的敲除误导脑血管形成,并减轻了血管畸形的程度。此外,另一项研究使用mirdatabank中miRNA靶基因的信息预测miRNA在肺癌治疗中的应用,并发现miRNA在肺癌治疗中的潜在作用,为肺癌治疗提供了新的思路。

包含mirdatabank的词条插图

4、未来展望

随着miRNA在生命科学研究中的研究逐步深入,mirdatabank作为miRNA功能信息的重要存储库,将继续发挥重要作用。未来,mirdatabank还将不断增强自身的数据质量和量,提供更加完善的miRNA功能信息,并扩大应用领域,为生命科学研究做出更大的贡献。

总结:

在本文中,我们对包含mirdatabank的词条进行了详细介绍。mirdatabank作为miRNA最大的功能数据库之一,在miRNA调控、疾病诊断和治疗以及药物开发等领域表现出强大的应用潜力。我们介绍了mirdatabank的定义、数据库结构和内容、数据下载和应用以及未来展望。通过本文的介绍,读者将能够更好的了解mirdatabank及其在生命科学研究中的应用。

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